Действие The Crystal Skull начинает разворачиваться в столице древней Мексики незадолго до её захвата конкистадорами. Императору снится сон, в котором некий юноша приносит ему хрустальный череп, способный, по всей видимости, спасти страну от угрозы уничтожения. Проснувшись и услышав вести о появлении кораблей с белыми людьми, владыка ацтеков приказывает во что бы то ни стало разыскать виденного им молодого человека. Как можно догадаться, этот последний и оказывается нашем героем: зовут его Кетцаль, и служит он смотрителем птиц в царском зоопарке, просыпаясь в начале игры в полном неведении относительно внезапно возникшего в верхах интереса к его скромной персоне. А точнее даже – угрозы его жизни: интриги вокруг власти плетутся здесь ничуть не меньшие, нежели в Версале или в Иерусалиме эпохи крестоносцев, и некоторые высокопоставленные чиновники готовы пойти на всё, лишь бы наш протагонист никогда не смог встретиться с императором...

(Macintosh)